Mikroorganismi sastāda mazāk kā 0,5% no augsnes masas. Galvenās mikroorganismu grupas, kas ir sastopamas augsnē:
Saprofītiskie – organismi, kas rada trūdvielas,
Autohtona mikroflora jeb trūdvielu noārdītāji
Oligotrofie mikroorganismi
Autotrofie mikroorganismi
Visbiežāk izplatītākie augsnes mikroorganismi ir baktērijas( 107-109/g),sēnes (parasti virsējos slāņos(105-106) mazāk sastopami organismi ir aļģes (103-104/g) vienšūņi (104-105/g) un vīrusi.
Augiem ļoti svarīga mikroorganismu grupa, kas spēj saistīt gaisā esošo slāpekli. Tādas ir brīvi dzīvojošās Pseudomonas, Anabaena, Clostridium, Chlorobium spp. baktērijas, kas spēj saistīt līdz 30 kg N/ha gadā un gumiņbaktērijas (rizobijas) Rhizobium, Sinorhizobium spp. Šie mikroorganismi simbiozē ar tauriņziežiem un atrodas uz šo augu saknēm un fiksē gaisā esošo slāpekli tādā veidā palielinot augsnes ražību.
Mikroorganismu daudzums atšķiras dažāda tipa augsnēs, jo auglīgāka augsne jo vairāk sastopami ir mikroorganismi, auglīgās zemēs tie mineralizē 2 -5 % no augsnes organisko vielu /g. …