Dzelzceļa kravu pārvadājumu muitas kontroli regulējošie LR normatīvie akti savas sadrumstalotības, kā arī, atšķirīgo un nepilnīgo prasību dēļ, radā situācijas, risinot kuras, muitas kontroles efektīvitāte nevar sasniegt vēlamos rezultātus. Pēdējos gados ir pieņemtas un izdarītas vairākas izmaiņas un papildīnājumi minētajos normatīvajos aktos, bet tie neatrisina visas nepilnības. Lai varētu noregulēt šos jautājumus kātrā institūcionālajā līmenī, nepieciešami izstrādāt normatīvo dokumentu, kurš apvienotu vairāku muitas lietas regulējošo normatīvo aktu prasības.
Lai muitas iestāde un to amatpersonas varētu veikt efektīvu un konsekventu muitas kontroli dzelzceļa kravu pārvadājumos, svarīgākie jautājumi, kurus ir jāatrisina nekavējoši un šodienas spēkā esošie normatīvie akti to pieļauj, ir sekojošie:
vienkāršotas muitas deklarācijas izmantošana noformējot kravu pieteikšanu pirmsmuitošanas darbībai vai tranzīta muitas procedūrai;
galvojuma izmantošana par muitas kravām dzelzceļa pārvadājumos;
muitas kravu pieteikšanas un muitas kontroles formalitāšu kārtošanas secības optimizēšana;
fizisko un juridisko personu, kas veic dzelzceļa kravu pārvadājumus, tiesiskas atbildības nodrošināšana;
tukšo vagonu pārvietošana muitas kontrolē;
muitas spiedogu pilnveidošana un to unificēta lietošana;…