Pēc galvenās risināmās problēmas atpazīšanas jebkuram projektam vienmēr nepieciešams noteikt mērķi (dažreiz to sauc par projekta tiešo mērķi). Atsevišķās projekta atlasēs pieļauj vai pat iesaka norādīt vairākus mērķus. Bieži jānorāda arī projekta vispārējais mērķis.
Projekta mērķi (gan tiešo, gan vispārējo) jānosaka situācijas analīzes un pirms aktivitāšu izstrādes. Projekta mērķi jāizstrādā ļoti precīzi, atbilstoši atpazītajai problēmai un iespējamiem risinājumiem, kurus pieļauj konkrētā konkursa projekta nosacījumi. Ja, piemēram, konstatēts, ka zem Zemgales plānošanas reģionā ir vāja darbinieku spēja kvalitatīti sagatavot projektu iesniegumus struktūrfondiem un citu ārvalstu finanšu instrumentiem, tad kā risinājums būtu pirkt pakalpojumus no uzņēmumiem vai privātpersonām, tomēr konkrētais konkurss šādu risinājumu neparedz. Atliek izvēlēties variantu par savu darbinieku apmācību projektu iesniegumu sagatavošanā.…